я делал так, когда продавал лодку без мотора снял с учета, когда снимал, сказал, что мотор продавать не буду, оригинал судового с отметкой о снятии отдал покупателю, себе оставил копию, заверенную ГИМСом когда потом ставил, принес копию судового и док-ты на новую лодку, все попробуй позвонить в Лодки Питер по твоему вопросу, они на учет раньше точно ставили без твоего участия